2강 / 20강

홈이 두 가지다 — 닫힌 것과 열린 것

클래스 I 과 II · 조각 길이가 그 차이를 그대로 보여 준다

접시는 한 가지가 아닙니다. 두 가지입니다. 그리고 이 둘의 차이가 CD4 와 CD8 이 갈리는 이유의 절반입니다.

클래스 I — HLA-A · B · C

사슬 하나가 홈을 다 만든다(α1+α2).
작은 β2-마이크로글로불린이 아래를 받친다.
거의 모든 유핵세포에 있다.
보조수용체 CD8

클래스 II — HLA-DR · DQ · DP

사슬 둘이 반씩 낸다(α1+β1).
두 사슬 모두 막을 관통한다.
수지상세포 · 대식세포 · B세포 위주.
보조수용체 CD4

구조를 외울 필요는 없습니다. 하나만 기억하면 됩니다.

클래스 I 의 홈은 양끝이 막혀 있고, 클래스 II 의 홈은 양끝이 트여 있다

고등학생홈이 두 가지다

MHC 에는 클래스 I 과 클래스 II 가 있다. 가장 눈에 띄는 차이는 홈의 모양 이다.

	클래스 I	클래스 II
홈의 양끝	닫혀 있음	열려 있음
조각 길이	8~11 아미노산	13~25 아미노산
보는 T세포	CD8	CD4
내용물의 출처	세포 안	세포 밖에서 먹은 것

구조의 차이가 길이의 차이를 그대로 만든다

막힌 홈은 길이를 정한다

클래스 I 의 홈은 양끝에 보존된 아미노산이 마개처럼 박혀 있습니다. 조각의 첫 글자와 마지막 글자를 그 마개가 붙잡습니다. 그래서 조각이 너무 길면 들어가지 못하고, 너무 짧으면 양끝이 닿지 않습니다.

클래스 II 는 마개가 없습니다. 조각이 양쪽으로 삐져나옵니다. 빵 밖으로 나온 소시지처럼요. 그래서 길이 제한이 훨씬 느슨합니다.

이건 그림 설명이 아니라 측정할 수 있는 예측입니다. 실제 자료로 확인해 봅시다.

클래스 I 은 9글자에 못이 박힌 듯 몰려 있고, 클래스 II 는 퍼져 있습니다.

Python 브라우저에서 실행

# 클래스마다 조각 길이가 어떻게 다른가 — 고유 에피토프만 센다
import thla

for cls in ["I", "II"]:
    L = thla.epitope_len(cls)
    print(f"클래스 {cls}  에피토프 {len(L):,}가지  중앙값 {int(L.median())}글자")
    h = L.value_counts().sort_index()
    for n, c in h.items():
        bar = "█" * max(1, int(60 * c / h.max()))
        print(f"   {n:>2}글자 {c:>5}  {bar}")
    print()

고등학생닫힌 홈과 열린 홈

클래스 I — 서랍

양끝이 막혀 있어서 정해진 길이 만 들어간다. 조각의 양끝이 홈의 주머니에 고정된다.

그래서 8~11개로 길이가 좁게 정해진다. 길면 안 들어가고, 짧으면 헐렁하다.

클래스 II — 터널

양끝이 열려 있어서 길어도 된다. 가운데 9개 정도가 홈에 앉고 나머지는 양쪽으로 삐져나온다.

	길이 분포
클래스 I	9 에 뾰족한 봉우리
클래스 II	넓게 퍼짐

구조를 알면 자료에서 나올 분포의 모양을 예측할 수 있다

클래스 I 은 9글자 하나가 84%를 차지합니다. 마개가 있다는 증거예요.

Python 브라우저에서 실행

# 9글자가 몇 %인가
import thla

F = thla.facts()
for cls in ["I", "II"]:
    h = F["ep_len"][cls]
    tot = sum(h.values())
    top = max(h, key=lambda k: h[k])
    print(f"클래스 {cls}: 가장 흔한 길이 {top}글자 = {h[top]:,}/{tot:,} = {100*h[top]/tot:.1f}%")
    lo = min(int(k) for k in h)
    hi = max(int(k) for k in h)
    print(f"          길이 범위 {lo}~{hi}글자")

고등학생왜 다른 출처를 다루나

	클래스 I	클래스 II
조각의 출처	세포질 단백질	먹어서 들어온 것
가공 장소	프로테아좀 → ER	엔도솜/리소좀
어느 세포에 있나	거의 모든 유핵세포	항원제시세포만

이 분업이 논리적이다

클래스 I 은 "내 안에 무엇이 있나" 를 보고한다. 그러니 모든 세포가 갖고 있어야 한다 — 어느 세포든 감염될 수 있으니까.

클래스 II 는 "밖에서 무엇을 주웠나" 를 보고한다. 그것은 전문 세포 의 일이다.

보고하는 내용이 다르니 보고하는 세포도 다르다

고등학생교차제시라는 예외

규칙에 예외가 있다. 수지상세포는 밖에서 주운 것을 클래스 I 에 얹을 수 있다.

이것이 왜 필요한가

바이러스에 감염된 세포를 죽이려면 CD8 T세포 가 필요하다. 그런데 수지상세포 자신은 감염되지 않았다.

감염된 세포를 먹어서 그 조각을 클래스 I 에 얹을 수 있어야 CD8 T세포를 교육할 수 있다.

세포	교차제시 능력
cDC1 (XCR1⁺)	특기
다른 DC	제한적
대식세포	거의 없음

규칙의 예외가 항종양 면역의 핵심 경로다 — 자세히는 /innate 14강

🤔 확인 문제

클래스 I 에 실리는 조각이 9글자 근처에 몰리는 가장 직접적인 이유는?

🤔 확인 문제

클래스 II 에 실리는 조각이 더 긴 이유는?

🤔 확인 문제

클래스 I 과 클래스 II 의 발현 세포에 대해 맞는 것은?