16강 / 20강
볼케이노 플롯 — 차등발현을 한 장에
가로는 log2FC, 세로는 −log10(p)
차등발현 결과를 한 장으로 보는 표준 그림이 볼케이노 플롯입니다. 축 두 개가 이렇게 정해져 있어요.
세로축에 마이너스 로그를 씌우는 것이 요령입니다. p 는 작을수록 좋은데, 그대로 그리면 좋은 것이 바닥에 깔려요. −log10 을 씌우면 뒤집혀서 위로 올라갑니다.
p = 0.05 → 1.3 · p = 0.001 → 3 · p = 1e-8 → 8
점선 세 개가 논문의 문턱입니다 — 세로 둘이 log2FC, 가로 하나가 p.
Python
브라우저에서 실행
🤔 확인 문제
볼케이노 플롯의 세로축에 −log10(p) 를 쓰는 이유는?
해설 −log10 을 씌우면 p=0.05 → 1.3, p=1e-8 → 8 이 됩니다. 확실한 것일수록 위로 가서 눈에 띄어요.