4강 / 20강

리스트 — 유전자 목록을 담는다

논문 SI 「40 genes related to the antigen-presenting pathway」

유전자가 하나면 이름표 하나로 됩니다. 그런데 40개라면요?

논문은 항원제시 경로의 유전자 40개 목록으로 표본을 걸렀습니다. 그런 목록을 담는 것이 리스트입니다.

[값, 값, 값, …]

대괄호로 감싸고 쉼표로 나눕니다. 문자열처럼 0부터 세고, [:3] 처럼 잘라 쓸 수 있어요.

고등학생유전자 40개를 어떻게 담을까

유전자가 하나면 이름표 하나로 됩니다.

유전자 = "B2M"

그런데 40개라면요? 이름표를 40개 만들 수는 없죠. 유전자1, 유전자2, … 유전자40? 생각만 해도 끔찍합니다.

그래서 리스트

[값, 값, 값, …] — 대괄호로 감싸고 쉼표로 나눈다

하나의 이름표로 여러 값을 담습니다.

비유 — 장바구니

마트에서 물건을 살 때 손에 하나씩 들고 다니지 않죠. 장바구니 하나에 다 넣습니다.

장바구니	리스트
물건을 넣는다	`.append()`
몇 개인지 센다	`len()`
세 번째 것을 꺼낸다	`목록[2]` (0부터!)
우유가 있나 본다	`"우유" in 목록`

문자열과 규칙이 같습니다

3강에서 배운 것이 그대로 통합니다 —

0부터 센다
[-1] 이 마지막
[:3] 으로 앞 셋을 자른다

문자열은 글자의 리스트라고 생각하면 된다

파이썬이 잘 설계된 부분입니다. 한 번 배운 규칙이 여러 곳에 똑같이 적용돼요. 외울 것이 줄어듭니다.

논문에서 어디에 쓰이나

논문은 항원제시 경로 유전자 40개 목록으로 표본을 걸렀습니다. /immunology 3강에서 배운 그 필터예요.

"이 환자의 돌연변이 유전자가 그 40개 안에 있나?" 를 in 하나로 묻습니다.

<code>in</code> 하나로 '들어 있나' 를 물을 수 있습니다.

Python 브라우저에서 실행

# 논문에 나오는 유전자들
경로유전자 = ["B2M", "HLA-A", "HLA-B", "HLA-C", "TAP1", "TAP2", "TAPBP", "NLRC5"]

print("목록      ", 경로유전자)
print("몇 개     ", len(경로유전자))
print("첫 번째    ", 경로유전자[0])
print("마지막     ", 경로유전자[-1])
print("앞 셋      ", 경로유전자[:3])
print()

# 하나씩 꺼내 본다
for g in 경로유전자[:4]:
    print("  검사 중:", g)
print()

# 들어 있나 확인
print("B2M 이 목록에 있나?  ", "B2M" in 경로유전자)
print("DDX54 가 목록에 있나?", "DDX54" in 경로유전자)

고등학생in 하나로 '들어 있나' 를 묻는다

코드에서 in 이라는 낱말이 나옵니다. 영어 그대로 "안에 있나" 입니다.

"B2M" in 경로유전자 → True 또는 False

2강의 참거짓이 여기서 쓰입니다

결과가 bool 자료형이에요. 그리고 이 값을 그대로 조건에 넣을 수 있습니다 (6강).

if "B2M" in 경로유전자: → "만약 목록에 있으면…"

for 문 — 하나씩 꺼내기

코드에 for g in 경로유전자: 가 나옵니다.

"목록에서 하나씩 꺼내 g 라고 부르며 반복하라"

영어 문장처럼 읽힙니다 — for each g in 경로유전자. 파이썬이 읽기 쉽다는 말이 이런 뜻이에요.

비유 — 출석 부르기

선생님이 명단을 들고 이름을 하나씩 부릅니다.

교실에서	코드로
명단	`경로유전자`
지금 부르는 이름	`g`
한 명씩 다 부른다	`for g in 경로유전자:`

g 라는 이름은 여러분이 정하는 겁니다. for 유전자 in 경로유전자: 라고 써도 똑같이 돌아요. 읽기 좋게 지으면 됩니다.

들여쓰기가 중요합니다

for 줄 아래에 들여 쓴 줄들이 반복되는 부분입니다. 들여쓰기를 안 하면 반복 밖이 돼요.

7강에서 제대로 다루는데, 파이썬에서 들여쓰기는 꾸밈이 아니라 문법입니다. 지금부터 조심하세요.

리스트를 만드는 세 가지 방법

방법	보기	언제
직접 적기	`["B2M", "TAP1"]`	몇 개 안 될 때
하나씩 붙이기	`목록.append(g)`	반복 안에서 모을 때
내포 표기	`[g for g in 전체 if 조건]`	거를 때 — 가장 많이 쓴다

세 번째가 파이썬답습니다. "전체에서 조건에 맞는 것만" 을 한 줄로 적어요. 논문의 표본 선별이 정확히 이 모양입니다.

고등학생리스트 컴프리헨션 — 문장처럼 읽으면 됩니다

본문에 [v for v in 값들 if v > 5] 같은 것이 나옵니다. 처음 보면 암호 같지만 영어 문장으로 읽으면 쉽습니다.

[ v for v in 값들 if v > 5 ]
"값들 중에서 · 5보다 큰 v 만 · 모아라"

읽는 순서

순서	부분	뜻
①	`for v in 값들`	값들에서 하나씩 꺼내 v 라 하고
②	`if v > 5`	5보다 큰 것만 골라
③	맨 앞의 `v`	그 v 를 새 리스트에 담는다

가운데 → 뒤 → 앞 순서로 읽으면 됩니다. 익숙해지면 한눈에 들어와요.

이렇게 쓰지 않으면

같은 일을 for 문으로 쓰면 네 줄입니다.

결과 = []
for v in 값들:
if v > 5:
결과.append(v)

네 줄이 한 줄이 됩니다. 그리고 파이썬 쓰는 사람들은 이 한 줄 쪽을 훨씬 자주 씁니다.

비유 — 수학의 집합 기호

수학에서 이렇게 쓰죠.

{ x | x ∈ A, x > 5 }

거의 똑같은 모양입니다! "A 에 속하면서 5보다 큰 x 들의 집합". 파이썬의 이 문법은 실제로 수학의 집합 표기에서 온 것이에요.

언제 쓰고 언제 안 쓰나

쓴다 — 한 줄로 읽히는 단순한 변환·거르기
안 쓴다 — 안에 조건이 여럿이거나 계산이 길 때. 그러면 for 문이 오히려 읽기 쉽습니다

짧은 게 늘 좋은 건 아닙니다. 읽히는 것이 좋은 겁니다.

논문의 11,070 → 9,707 도 이런 거르기가 네 번 이어진 것입니다.

Python 브라우저에서 실행

# 리스트 내포 — '거르기' 를 한 줄로
발현량 = [0.4, 12.8, 3.1, 0.02, 45.6, 8.9, 0.7, 22.3]

# 방법 1 — 반복으로 하나씩
높은것 = []
for v in 발현량:
    if v > 5:
        높은것.append(v)
print("반복으로 :", 높은것)

# 방법 2 — 내포 표기 한 줄 (같은 결과)
높은것2 = [v for v in 발현량 if v > 5]
print("한 줄로  :", 높은것2)
print()

# 값을 바꾸면서 거르기도 된다
import math
로그값 = [round(math.log2(v + 1), 2) for v in 발현량]
print("log2(v+1):", 로그값)
print()
print("원본", len(발현량), "개 →", len(높은것2), "개가 남았습니다.")

🤔 확인 문제

[v for v in 값들 if v > 5] 가 하는 일은?